Nástroj Pero
Nástrojem Pero vytvoříte rychlé náčrtky nebo poznámky od ruky v prostředí 
Nákresny, což může být užitečné například při online prezentaci nebo na interaktivní tabuli. Pro přidání náčrtku nebo poznámky od ruky do Nákresny, aktivujte nástroj a poté prstem nebo perem na dotykových zařízeních anebo tažením levou myší, pokud dotykové zařízení nemáte.
GeoGebra ukládá poznámku, kterou jste nakreslili v Nákresně jako objekt stroke (tah), na který je možné aplikovat některé akce a geometrické transformace (např. přesunout, otočit, zrcadlit,…).
Výchozí barva pera je černá, ale vlastnosti pera (barva, styl a tloušťka) lze změnit pomocí Formátovacího panelu.
Smazání tahu pera
Chcete-li vymazat část poznámky vytvořené pomocí nástroje Pero v Nákresně, vyberte nástroj Smazat a přesuňte prst (dotykové zařízení) nebo ukazatel myši, zatímco držíte stisknuté levé tlačítko nad částí, kterou chcete vymazat.
U zařízení bez dotykové obrazovky je také možné vymazat část poznámky tak, že podržíte pravé tlačítko myši a přesunete kurzor nad danou část a po dokončení tlačítko uvolníte.
Chcete-li úplně vymazat tah pera, vyberte objekt a zmáčkněte klávesu delete, nebo v Kontextovém menu objektu v Algebraickém okně nebo Nákresně zvolte příkaz Zrušit.